为了保证生物质锅炉运行期间的压力稳定性，必须不间断地根据供热情况来调整锅炉负荷和燃烧室的运行。通常情况下，生物质锅炉正常运行时会呈现出火床平整，火焰密而均匀的呈亮黄色，没有穿冷风的火口，燃烬段整齐一致，从烟囱冒出的烟呈淡灰色，炉膛负压保持在20～30Pa等的特征。

当锅炉负荷增加时，就需先增加引风再增加送风，然后加快炉排速度，必要时甚至还需要增加煤层厚度的方式来促进生物质锅炉的高效运行。而当锅炉负荷减少时，就需先减慢炉排速度，然后减少送风，再减少引风的方法来解决。增减鼓引风量主要是通过开大或关小鼓、引风调节门来达到，调节完毕后的生物质锅炉的炉膛负压仍需要保持在20～30MPa。

此外，生物质锅炉所用燃料的颗粒度及水分对锅炉的工作影响也很大。颗粒度不均在煤斗中易产生机械分离，造成炉排通风不均和火床的燃烧不均。细颗粒燃料过多则会造成通风不良易产生火口。可见粒度指标好坏也将直接影响到锅炉正常的稳定燃烧及其热效率的高低。